Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm26445-201ENSMUST00000177557 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm8254-201ENSMUST00000182326 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm32849-201ENSMUST00000208696 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm933-201ENSMUST00000179384 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC161117.2-201ENSMUST00000221908 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Add2-201ENSMUST00000032069 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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