Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms