Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Olfr1155-201ENSMUST00000099843 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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