Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Perm1Q149B8 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Perm1Q149B8 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms