Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
GscQ02591 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms