Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nbr1-206ENSMUST00000107213 4339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mitf-207ENSMUST00000203884 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Alox15-201ENSMUST00000019068 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm37699-201ENSMUST00000194753 3338 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lpin3-202ENSMUST00000109455 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Dgcr2-202ENSMUST00000066127 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm38024-201ENSMUST00000192338 2532 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms