Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms