Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cd28P31041 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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