Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Srp72F8VQC1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms