Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Lcn6A2AJB9 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lcn6A2AJB9 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lcn6A2AJB9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Lcn6A2AJB9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Lcn6A2AJB9 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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