Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sele-201ENSMUST00000027874 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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