Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms