Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Nop56Q9D6Z1 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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