Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Snx10Q9CWT3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms