Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Use1Q9CQ56 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms