Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp16Q99LG0 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp16Q99LG0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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