Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCS6

Pabpn1, Polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1Q8CCS6 Gm17031-201ENSMUST00000016698 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Fanci-202ENSMUST00000118959 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Prss28-201ENSMUST00000015267 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 A330094K24Rik-201ENSMUST00000180530 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm43442-201ENSMUST00000202865 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Fcer2a-207ENSMUST00000208492 1053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm18780-201ENSMUST00000209594 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC124687.4-201ENSMUST00000222361 463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pabpn1Q8CCS6 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Dmbx1-202ENSMUST00000084338 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hcfc1r1-202ENSMUST00000179928 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Olfr15-201ENSMUST00000080917 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm23973-201ENSMUST00000083320 321 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Sncaip-210ENSMUST00000179689 1512 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pabpn1Q8CCS6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Eif5a-204ENSMUST00000108607 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm24786-201ENSMUST00000157379 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm9844-201ENSMUST00000170837 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1Q8CCS6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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