Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atg16l1Q8C0J2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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