Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccser1Q8C0C4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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