Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ChfrQ810L3 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ChfrQ810L3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms