Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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