Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprdQ64487 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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PtprdQ64487 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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