Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Q3U6N9 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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