Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm45510-201ENSMUST00000210059 638 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm11489-201ENSMUST00000118342 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm25092-201ENSMUST00000103996 129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm2324-201ENSMUST00000187464 662 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm45566-201ENSMUST00000209883 1168 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Top3a-201ENSMUST00000002891 3741 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TrioQ0KL02 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm7761-201ENSMUST00000190510 921 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ccdc15-201ENSMUST00000037275 3525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC100729.1-201ENSMUST00000225458 1454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms