Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GscQ02591 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GscQ02591 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GscQ02591 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
GscQ02591 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
GscQ02591 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms