Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Vmn1r41-206ENSMUST00000228068 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rnf41-202ENSMUST00000171342 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Abi2-210ENSMUST00000189980 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Rps6ka1-205ENSMUST00000157067 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Pld5-201ENSMUST00000065967 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Xpnpep2-203ENSMUST00000115000 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm42575-201ENSMUST00000202942 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gapdhs-201ENSMUST00000074758 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Cenpu-201ENSMUST00000034045 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irx2P81066 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms