Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx2P80206 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms