Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Nod2-203ENSMUST00000118370 4653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SbdsP70122 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms