Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rpl28P41105 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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