Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd8P23463 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd8P23463 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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