Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC140449.1-201ENSMUST00000214600 1459 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxb4P10284 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ralyl-201ENSMUST00000108372 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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