Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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Ccl20O89093 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ccl20O89093 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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