Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf169E9Q7F2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.6 ms