Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ccdc146-201ENSMUST00000030552 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Col5a3Q9JLI2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Cnih3-203ENSMUST00000162685 602 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm33815-205ENSMUST00000195574 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC154548.2-201ENSMUST00000224621 469 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pdzk1ip1-201ENSMUST00000030488 1119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tes-201ENSMUST00000076654 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Rassf9-201ENSMUST00000055355 1526 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms