Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Fam240a-201ENSMUST00000177678 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Speer4bQ9D9F7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Speer4bQ9D9F7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms