Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kdm5aQ3UXZ9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28309-201ENSMUST00000136302 623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40604-201ENSMUST00000217765 655 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rad52-212ENSMUST00000162461 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12977-201ENSMUST00000133742 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Kdm5aQ3UXZ9 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 1700018A04Rik-203ENSMUST00000150418 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm5aQ3UXZ9 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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