Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Grin2cQ01098 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms