Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Etfbkmt-202ENSMUST00000111547 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 AC165159.1-201ENSMUST00000223825 631 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 1810019D21Rik-203ENSMUST00000145343 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Serpina10-202ENSMUST00000121625 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm12700-201ENSMUST00000118145 457 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm42871-201ENSMUST00000199333 315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm12188-201ENSMUST00000117387 310 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.7 ms