Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PrcdQ00LT2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Tomm40l-201ENSMUST00000005817 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
PrcdQ00LT2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms