Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmod1P49813 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms