Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nnt-206ENSMUST00000223268 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms