Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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