Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Slc1a6O35544 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms