Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm6225-201ENSMUST00000181558 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 1810059H22Rik-202ENSMUST00000203662 546 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Apoc3-201ENSMUST00000034586 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col4a6B1AVK5 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm7799-201ENSMUST00000133080 476 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Tox-201ENSMUST00000039987 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Asb5-201ENSMUST00000033918 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col4a6B1AVK5 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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