Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RhoaQ9QUI0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms