Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc97Q9DBT3 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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