Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp12Q9D9M2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms