Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms