Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms