Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm43628-201ENSMUST00000197871 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rpl14-ps1-201ENSMUST00000026901 653 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cass4-204ENSMUST00000228775 2629 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rbm4-201ENSMUST00000164209 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zcchc9-201ENSMUST00000022121 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm14138-201ENSMUST00000122061 745 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gnb2-214ENSMUST00000168746 802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 5031425E22Rik-203ENSMUST00000188328 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp54Q8BL06 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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